病毒核酸检测范文第1篇
一、基本原则
按照“统一领导、立足全乡、全面动员、分级负责、反应迅速、处置果断、精准检测、加强配合”的原则开展核酸检测工作。
二、检测范围
根据疫情发生情况,科学、精准划定检测范围。
(一)村居(社区)全员检测。
经专家组研判,疫情传播风险仅局限于某个村居或社区,在某个村居或社区开展全员检测。
(二)全乡全员检测。
经专家组研判,疫情传播风险局限在乡域范围,且不会造成周边乡镇传播风险,在全乡范围开展全员检测。
三、检测程序
根据疫情防控需要和感染风险评估结果,确定风险人群范围,根据感染风险大小确定检测优先次序,实现检测区域内的户籍人口、暂住人口和流动人口核酸检测应检尽检,不漏一人。
(一)重点人群。
疫情发生后对病例和无症状感染者的密切接触者、密接的密接以及有共同暴露史人群第一时间开展检测;其次对报告疫情村居人员、疫情发生地周边村居人员以及区域内快递员、出租车司机、公交车司机等人员开展检测,实行单人单管,标本采样送检应在接到报告后的6小时内完成,检测机构必须在收到标本后6小时内反馈检测结果。
(二)局部区域居民。
疫情发生后,需局部区域居民检测的,除重点人群外,其他居民按1:10混样采集样本,2天内完成标本采集及核酸检测工作。难以按期完成的,报乡指挥部,由乡统一调配力量。
(三)全员居民。
疫情发生后,需全员居民检测的,除重点人群外,其他居民按1:10混样采集样本。全乡范围内全员检测在3天内完成标本采集及核酸检测;难以按期完成的,由乡委领导小组上报县委领导小组申请对口支援。
(四)检测顺序。
按照重点人群→医务人员、采样人员、检测服务人员→其他居民的顺序开展采样及核酸检测工作。
全员检测根据专家组研判结果,按疫情发生点为核心,渐次扩大检测区域:核心村居→核心社区→全乡。
四、队伍组成
(一)社防队。
以村为单位组建,要明确各防控队区域分工及联络员、联系方式。结合人口普查,负责对辖区内居住人口开展摸排、登记并形成一览表(包括村居、姓名、性别、年龄、身份证、联系电话(本人或者家人)、是否是常住人口,在全员核酸检测时负责召集和组织有序检测等工作。
(二)采样队。
以现有采样队为基础,结合辖区居民数量,按照每人每天采样500份标准,进一步扩充采样人员数量,全乡至少配备60名采样队员的预备队。卫生院至少配备4人的采样预备队。当开展全员检测时,社区采样预备队作为第一梯队,其他社区采样预备队作为第二梯队进行支援。按每个采样小组由2名采样人员,4-5名登记管理人员组成。组长由管理区书记或主任担任,小组所有工作以服务和满足顺畅采样为核心。加强采样人员技术培训和采样小组个人防护演练。每一名采样人员必须经过生物安全培训及采样技术培训,合格后方可进行样本采集工作。
(三)信息队。
每个采样小组登记管理人员4-5人中有1名卫生专业人员,其他人员以机关干部、基层工作人员和志愿者组成。每个采样小组配备电脑至少1台、采样(转运)箱和采样用品若干(满足每天最大采样量)。由卫生专业人员每天按照规定时间汇总采样情况进行上报。采样登记管理人员需熟悉微机操作,负责样本采集登记、信息录入等工作。机关干部按各部门、单位全体在职干部1/4-1/3的员额准备;基层干部按1/2-2/3的员额准备。
(四)检测队。
卫生院确定1名核酸检测人员作为县级检测第二梯队。后备检测人员培训要在11月中旬前完成。
(五)流调队。
在现有流调队伍基础上,进一步优化队伍组成,将公安、通信、社区等相关部门、单位工作人员一并纳入,紧密配合,确保第一时间开展密接、次密接、一般接触者、可疑暴露者以及其他有风险人员的排查工作。组织专家组,统一调度流调信息,特别要充分利用好大数据,研判疫情形势,提出检测的技术意见,增加流调、检测工作的精准性、科学性、可靠性。
(六)送样队。
要科学调配标本运送车,每车确定2-3名运送人员。要加强标本转运人员个人防护和转运知识培训,确保在符合生物安全要求的情况下,进行标本的收集和转运工作,第一时间送至指定的检测机构。
(七)消杀队。
由乡指挥部组建专业消杀队,主要负责疫点、疫区、病例和标本转运车辆的消杀和指导。各村居(社区)组建不少于30人的环境消杀队,主要负责村居环境消杀管理。
(八)维稳队。
每个采样点至少配备2名公安干警、5-10名维稳人员,负责采样点秩序维持(配备隔离线)、安全稳定、个人防护监督等工作,确保采样安全有序进行。对不服从安排、扰乱采样秩序等人员依法依规予以处理。
(九)后勤队。
由乡党政办公室组建后勤保障队,负责采样检测人员的生活保障。
(十)校验队。
负责对登记的信息进行校验,录入健康码系统。在专业人员指导下,由熟悉微机操作的机关干部,按每人每天录入2000条信息的标准准备,在检测结果出来后24小时内录入系统。
(十一)协调队。
由乡领导小组(指挥部)及有关工作专班组成,分力量调度、信息核查等若干小组,综合协调调度,汇总相关信息。由乡疫情防控指挥部办公室协调汇总相关信息。
五、采样点设置
(一)集中采样点。
在人口密集地的社区、村庄、学校、企业等设置集中采样点,原则上每个采样点覆盖人口2000人左右。每个集中采样点设若干采样小组。采样小组的数量按一天内全部完成采样设置。采样场地优先选择体育场、广场、学校操场、公园等相对空旷、通风良好、有电力供应的地区,被采集人员单向有序流动,无交叉,具备一定的现场消杀及采样人员个人防护要求,标本存放运输符合生物安全要求。
(二)流动采样点。
对偏远地区或人员较少的地方,设置流动采样点。设置原则参照集中采样点。
六、被采样人员注意事项
为保证核酸检测工作有序推进,避免交叉感染,要求被采样人员需做到:
(一)带好身份证等个人有效证件和手机;
(二)做好个人防护,在等待检测过程中佩戴口罩,检测完后立即戴上口罩;
(三)有序排队检测,尽量相距1米以上;
(四)采样前2小时尽量避免进食,采样前30分钟不吸烟、喝酒、咀嚼口香糖;
(五)听从指挥,主动配合,采集完成后尽快离开采集点;
(六)核酸检测前后注意手部卫生,使用免洗手消毒液或免洗酒精擦拭双手。
六、组织实施
(一)乡领导小组(指挥部)负责组织实施全乡全员检测工作、指挥调度检测、采样队伍支援保障,对全乡检测相关流程进行规范指导。
(二)乡镇领导小组(指挥部)负责辖区内采样检测任务。
根据检测人群数量,统一部署采样点设置、人员组织、信息登记、采集流程、转运送检、核酸检测等工作,统筹安排采样队伍和检测队伍,确保规定时间内完成检测任务。
七、工作保障
按照谁执行任务谁负责保障的原则落实属地、单位责任。
(一)资金保障。
全员检测所需资金由乡财政承担,不得对被采样人员收取任何费用。
(二)物资保障。
统筹做好物资(车辆、耗材、试剂、防护用品、转运箱、电脑、遮阳棚、桌椅等)采购及储备工作,常态储备量要不低于总需求量的30%。物资2小时到位率达到100%。必要时可以征用、借用。
(三)信息保障。
各检测机构、采样点、采样队伍之间要建立联系,指派专人负责,明确联络员,保证信息畅通,确保第一时间反馈检测信息。
(四)安全保障。
所有工作人员要加强个人安全防护。采集和运送低风险区域人群的工作人员,可采用二级生物安全防护;标本接收和检测人员,采用三级生物安全防护。所有被采样人员要佩戴口罩,现场测量体温。
病毒核酸检测范文第2篇
核酸的定义:核酸是由核苷酸或脱氧核苷酸通过3′,5′-磷酸二酯键连接而成的一类生物大分子。
核酸具有非常重要的生物功能,主要是贮存遗传信息和传递遗传信息。
2.核酸的分类
核酸大分子可分为两类:脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。
3.核酸的组成
DNA和RNA都是由一个一个核苷酸(nucleotide)头尾相连而形成的,由C、H、O、N、P,5种元素组成。DNA是绝大多数生物的遗传物质,RNA是少数不含DNA的病毒(如HIV病毒,流感病毒,SARS病毒等)的遗传物质。RNA平均长度大约为2000个核苷酸,而人的DNA却是很长的,约有3X10^9个核苷酸。
4.核酸的功能
在蛋白质的复制和合成中起着储存和传递遗传信息的作用。核酸不仅是基本的遗传物质,而且在蛋白质的生物合成上也占重要位置,因而在生长、遗传、变异等一系列重大生命现象中起决定性的作用。
DNA与RNA都是核酸,它们在化学组成上有什么区别如下:
DNA与RNA的比较
DNA
RNA
主要存在部位
细胞核
细胞质
基本组成单位
脱氧核苷酸
核糖核苷酸
碱基种类
A、G、C、T
A、G、C、U
五碳糖种类
脱氧核糖
核糖
核苷酸链
两条脱氧核苷酸链
一条核糖核苷酸链
5.检测方法
核酸检测方法,主要通过同时进行靶核酸扩增和可检测信号的生成来检测样品中的靶核酸。可应用于临床微生
物学、血液筛选、遗传病诊断和预防、法医学等领域的核酸检测。
目前主要使用的方法有以下几种:
a.核酸序列依赖性扩增法
NASBA是由一对引物介导的、连续均一的、体外特异性核苷酸序列等温扩增RNA的新技术。反应在42℃进行,可在2h内将RNA模板扩增约109倍。NASBA原理是提取病毒RNA,加入AMV逆转录酶、RNA酶H、T7RNA聚合酶和引物进行扩增。整个反应分非循环相和循环相:在非循环相中,引物I与模板RNA退火后在AMV逆转录酶的作用下合成cDNA,形成RNA:DNA杂合体,随即RNaseH降解RNA,引物Ⅱ与cDNA退火,在反转录酶作用下合成第2条DNA互补链。双链DNA可在T7RNA聚合酶的作用下,经其启动子序列起动而转录RNA,RNA又可在反转录酶的作用下反转录成DNA,进入循环相,对模板进行大量扩增。
b.转录介导的扩增技术
TMA技术原理与NASBA基本一致,略有不同之处是TMA利用的是MMLV逆转录酶及T7RNA聚合酶两种酶,MMLV逆转录酶既有逆转录酶的活性又具有RNA酶H活性。反应在41.5℃进行,可在1h内将RNA模板扩增约109倍。
c.连接酶酶促链式反应(LCR)
LCR是基于靶分子依赖的寡核苷酸探针相互连接的一种
探针扩增技术,是继PCR后新发展的一种较有前景的体外扩增技术。它的原理就是由2段寡核苷酸单链DNA探针与目标序列杂交,当该2段DNA探针与没有发生突变的模板褪火后,如果2探针是紧邻的,中间没有核苷酸间隔,则可在连接酶作用下连接起来,连接以后的新链又可以作为模板,引导下一周期的连接产生新的子链。若连接区段发生核苷酸的碱基突变,则连接反应不能发生,扩增反应终止。
d.多聚酶链反应检测法(PCR)
PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性退火延伸三个基本反应步骤构成。
①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备。
②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。
③引物的延伸:DNA模板引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成1条新的与模板DNA链互补的半保留复制链,重复循环变性退火延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次
循环的模板。每完成1个循环需2~4min,2~3h就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。检测HIVRNA,需要先利用逆转录反应将RNA转录为cDNA,继而以cDNA为模板进行PCR扩增即可,这样的反应称为RT-PCR。
e.实时荧光定量PCR技术
实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
本技术的原理是使用荧光基团标记探针,5′端标记荧光基团R,3′端标记淬灭基团Q,在没有PCR扩增时,由于荧光基团和淬灭基团空间距离很近,使荧光基团被淬灭,不发荧光;而当PCR扩增时,引物与荧光标记的特异性探针同时结合在模板上,荧光标记的探针与模板的结合位置位于上下游引物之间,利用Taq酶的5′3′外切酶活性,将荧光探针水解,荧光基团被释放出来,由于在空间上与淬灭基团分开,则发出荧光。发出的荧光可以被荧光探头检测到,一边扩增,一边检测,这样就实现了“实时”检测。该技术不仅实现了PCR从半定量到定量的飞跃,而且与常规PCR相比,它具有特异性强、自动化程度高、有效解决了PCR污染问题等特点。
f.支链DNA检测法bDNA
bDNA是定量检测血浆中的HIV1型RNA的一种方法。bDNA是指人工合成的带有侧链的DNA片段,在其每个侧链上
都可以标记被激发的标记物。将HIV的RNA通过离心从病毒颗粒中释放出来,然后用捕获探针1将其捕获到微孔中。捕获探针2与病毒RNA的另一部分特异结合,又与预放大探针结合。后者再与放大探针即bDNA探针杂交。两套靶探针分别与病毒RNA的pol基因的不同区域特异结合。在微孔中形成HIVRNA寡核苷酸复合物。再加入1种化学发光底物孵育后可放大化学发光信号。通过发光强度来定量,因为发光强度与样品中HIVRNA含量成比例。bDNA不存在扩增物的交叉污染,这较PCR是一大进步。bDNA有数十个覆盖整个基因组的探针,可以方便地检测HIV某些变异株,但灵敏度不及PCR,提高bDNA灵敏度是一大难点。
检测步骤
HIV核酸定性检测技术,其检测过程分为核酸提取、逆转录合成cDNA、PCR扩增反应、扩增产物定性分和结果判定和完成报告单。
6.实验室检测具体步骤如下:
a.核酸提取
使用硅胶柱离心、磁性硅胶颗粒分离方法以及自动化仪器等商品化试剂或设备并按说明书操作。提取RNA时应注意防止RNA降解。DNA应置于-20℃保存,RNA和需长期保存的DNA应置于-80℃保存。
b.逆转录合成cDNA
逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。建议使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。
c.PCR扩增反应(使用二次扩增的套式PCR扩增方法)
PCR反应需使用引物、dNTPs、DNA聚合酶(如Taq酶等)、缓冲液、和适量无RNA/DNA酶超纯水、以及模板(DNA或cDNA)。在扩增仪中,按照设定的程序进行扩增。使用二次扩增的套式PCR扩增方法。
e.扩增产物定性分析
扩增产物常用分析方法是琼脂糖凝胶电泳法,与分子量标准比较,判断扩增片段是否在预期的分子量范围内。其它扩增产物分析方法还有限制性内切酶酶切分析、特异性探针杂交分析以及DNA序列分析等。自动化核酸扩增仪使用酶联比色分析或荧光探针杂交等原理测定。
f.结果判定和完成报告单
(1)实验成立的条件:每一次检测需同时做两个阳性
对照、两个阴性对照,只有阳性对照扩增出预期的片段、阴性对照没有扩增出任何片段、双份平行样品结果一致的情况下实验才成立,可以作出核酸阳性或阴性反应结果的判定。
(2)HIV核酸检测阳性:发现核酸阳性反应,应该重复采集样品进行复测,复测结果呈核酸阳性反应则判定为核酸阳性,复测结果为核酸阴性反应则判为不确定结果,需进一步随访检测。
(3)HIV核酸检测阴性:只可报告本次实验结果阴性。
病毒核酸检测范文第3篇
核酸的定义:核酸是由核苷酸或脱氧核苷酸通过3′,5′-磷酸二酯键连接而成的一类生物大分子。
核酸具有非常重要的生物功能,主要是贮存遗传信息和传递遗传信息。
2.核酸的分类
核酸大分子可分为两类:脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。
3.核酸的组成
DNA和RNA都是由一个一个核苷酸(nucleotide)头尾相连而形成的,由C、H、O、N、P,5种元素组成。DNA是绝大多数生物的遗传物质,RNA是少数不含DNA的病毒(如HIV病毒,流感病毒,SARS病毒等)的遗传物质。RNA平均长度大约为2000个核苷酸,而人的DNA却是很长的,约有3X10^9个核苷酸。
4.核酸的功能
在蛋白质的复制和合成中起着储存和传递遗传信息的作用。核酸不仅是基本的遗传物质,而且在蛋白质的生物合成上也占重要位置,因而在生长、遗传、变异等一系列重大生命现象中起决定性的作用。
DNA与RNA都是核酸,它们在化学组成上有什么区别如下:
DNA与RNA的比较
DNA
RNA
主要存在部位
细胞核
细胞质
基本组成单位
脱氧核苷酸
核糖核苷酸
碱基种类
A、G、C、T
A、G、C、U
五碳糖种类
脱氧核糖
核糖
核苷酸链
两条脱氧核苷酸链
一条核糖核苷酸链
5.检测方法
核酸检测方法,主要通过同时进行靶核酸扩增和可检测信号的生成来检测样品中的靶核酸。可应用于临床微生
物学、血液筛选、遗传病诊断和预防、法医学等领域的核酸检测。
目前主要使用的方法有以下几种:
a.核酸序列依赖性扩增法
NASBA是由一对引物介导的、连续均一的、体外特异性核苷酸序列等温扩增RNA的新技术。反应在42℃进行,可在2h内将RNA模板扩增约109倍。NASBA原理是提取病毒RNA,加入AMV逆转录酶、RNA酶H、T7RNA聚合酶和引物进行扩增。整个反应分非循环相和循环相:在非循环相中,引物I与模板RNA退火后在AMV逆转录酶的作用下合成cDNA,形成RNA:DNA杂合体,随即RNaseH降解RNA,引物Ⅱ与cDNA退火,在反转录酶作用下合成第2条DNA互补链。双链DNA可在T7RNA聚合酶的作用下,经其启动子序列起动而转录RNA,RNA又可在反转录酶的作用下反转录成DNA,进入循环相,对模板进行大量扩增。
b.转录介导的扩增技术
TMA技术原理与NASBA基本一致,略有不同之处是TMA利用的是MMLV逆转录酶及T7RNA聚合酶两种酶,MMLV逆转录酶既有逆转录酶的活性又具有RNA酶H活性。反应在41.5℃进行,可在1h内将RNA模板扩增约109倍。
c.连接酶酶促链式反应(LCR)
LCR是基于靶分子依赖的寡核苷酸探针相互连接的一种
探针扩增技术,是继PCR后新发展的一种较有前景的体外扩增技术。它的原理就是由2段寡核苷酸单链DNA探针与目标序列杂交,当该2段DNA探针与没有发生突变的模板褪火后,如果2探针是紧邻的,中间没有核苷酸间隔,则可在连接酶作用下连接起来,连接以后的新链又可以作为模板,引导下一周期的连接产生新的子链。若连接区段发生核苷酸的碱基突变,则连接反应不能发生,扩增反应终止。
d.多聚酶链反应检测法(PCR)
PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性退火延伸三个基本反应步骤构成。
①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备。
②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。
③引物的延伸:DNA模板引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成1条新的与模板DNA链互补的半保留复制链,重复循环变性退火延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次
循环的模板。每完成1个循环需2~4min,2~3h就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。检测HIVRNA,需要先利用逆转录反应将RNA转录为cDNA,继而以cDNA为模板进行PCR扩增即可,这样的反应称为RT-PCR。
e.实时荧光定量PCR技术
实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
本技术的原理是使用荧光基团标记探针,5′端标记荧光基团R,3′端标记淬灭基团Q,在没有PCR扩增时,由于荧光基团和淬灭基团空间距离很近,使荧光基团被淬灭,不发荧光;而当PCR扩增时,引物与荧光标记的特异性探针同时结合在模板上,荧光标记的探针与模板的结合位置位于上下游引物之间,利用Taq酶的5′3′外切酶活性,将荧光探针水解,荧光基团被释放出来,由于在空间上与淬灭基团分开,则发出荧光。发出的荧光可以被荧光探头检测到,一边扩增,一边检测,这样就实现了“实时”检测。该技术不仅实现了PCR从半定量到定量的飞跃,而且与常规PCR相比,它具有特异性强、自动化程度高、有效解决了PCR污染问题等特点。
f.支链DNA检测法bDNA
bDNA是定量检测血浆中的HIV1型RNA的一种方法。bDNA是指人工合成的带有侧链的DNA片段,在其每个侧链上
都可以标记被激发的标记物。将HIV的RNA通过离心从病毒颗粒中释放出来,然后用捕获探针1将其捕获到微孔中。捕获探针2与病毒RNA的另一部分特异结合,又与预放大探针结合。后者再与放大探针即bDNA探针杂交。两套靶探针分别与病毒RNA的pol基因的不同区域特异结合。在微孔中形成HIVRNA寡核苷酸复合物。再加入1种化学发光底物孵育后可放大化学发光信号。通过发光强度来定量,因为发光强度与样品中HIVRNA含量成比例。bDNA不存在扩增物的交叉污染,这较PCR是一大进步。bDNA有数十个覆盖整个基因组的探针,可以方便地检测HIV某些变异株,但灵敏度不及PCR,提高bDNA灵敏度是一大难点。
检测步骤
HIV核酸定性检测技术,其检测过程分为核酸提取、逆转录合成cDNA、PCR扩增反应、扩增产物定性分和结果判定和完成报告单。
6.实验室检测具体步骤如下:
a.核酸提取
使用硅胶柱离心、磁性硅胶颗粒分离方法以及自动化仪器等商品化试剂或设备并按说明书操作。提取RNA时应注意防止RNA降解。DNA应置于-20℃保存,RNA和需长期保存的DNA应置于-80℃保存。
b.逆转录合成cDNA
逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。建议使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。
c.PCR扩增反应(使用二次扩增的套式PCR扩增方法)
PCR反应需使用引物、dNTPs、DNA聚合酶(如Taq酶等)、缓冲液、和适量无RNA/DNA酶超纯水、以及模板(DNA或cDNA)。在扩增仪中,按照设定的程序进行扩增。使用二次扩增的套式PCR扩增方法。
e.扩增产物定性分析
扩增产物常用分析方法是琼脂糖凝胶电泳法,与分子量标准比较,判断扩增片段是否在预期的分子量范围内。其它扩增产物分析方法还有限制性内切酶酶切分析、特异性探针杂交分析以及DNA序列分析等。自动化核酸扩增仪使用酶联比色分析或荧光探针杂交等原理测定。
f.结果判定和完成报告单
(1)实验成立的条件:每一次检测需同时做两个阳性
对照、两个阴性对照,只有阳性对照扩增出预期的片段、阴性对照没有扩增出任何片段、双份平行样品结果一致的情况下实验才成立,可以作出核酸阳性或阴性反应结果的判定。
(2)HIV核酸检测阳性:发现核酸阳性反应,应该重复采集样品进行复测,复测结果呈核酸阳性反应则判定为核酸阳性,复测结果为核酸阴性反应则判为不确定结果,需进一步随访检测。
(3)HIV核酸检测阴性:只可报告本次实验结果阴性。
病毒核酸检测范文第4篇
一、病原检验标本采集与送检的基本要求
标本的正确采集和运送是实验室取得正确结果的前提。但对标本采集的方法和时间,标本的来源,实验室常不能直接加以控制,因此,临床医师和护士必须对此予以高度重视。细菌检验标本采集与送检的基本原则包括:
(一)送检报告单应注明被检人的姓名、性别、年龄、临床诊断、标本来源及检验目的、抗生素使用情况,使实验室能正确选用相应的培养基和适宜的培养环境。
(二)尽量在抗生素使用前采集标本。
(三)在采集血液,脑脊液,穿刺液等标本时,应严格执行无菌操作,避免杂菌污染。
(四)标本采集后立即送到实验室,床边接种可提高病原菌的检出率。
(五)以拭子采集的标本如咽拭子,伤口拭子及时插入运送培养基送检,应采用吸水性好、不易干燥的材料取样。
(六)混有正常菌群的标本,如痰,尿液,伤口拭子,不可置肉汤培养基送检。
(七)盛标本容器须经灭菌处理,但不得使用消毒剂。
二、常见病原检验标本的采集送检方法
(一)血液与骨髓
1、通常采血部位为肘静脉,但感染灶附近血管采血,可提高阳性率。切忌在静滴抗菌药物的静脉处采集血标本。标本采集过程应严格无菌操作。
2、每次采血量为5-10ml,婴幼儿1-5ml,培养基与血液之比以10:1为宜。以稀释血液中的抗生素、抗体等杀菌物质。
3、选择体温上升时采血可提高阳性率。对已用抗菌药物而又不能停药者,应在下次用药前采血。
4、每例至少采血两次,间隔时间据病情而定,以利于提高阳性率和区别感染菌和皮肤污染菌。
(二)尿液
尿液标本的采集应严格进行无菌操作。由于治疗药物多数通过尿液排泄,因此,应在用药前采集尿液,且以晨起第一次尿送检为宜。尿培养送检单上必须注明标本采集方法及抗生素使用情况。
1、中段尿采集:是临床上最常用的方法。采样前须以肥皂水和清水洗净尿道口,排出的尿液前段须弃去,而将中段或近后段的尿液留于无菌容器中。
2、导尿管采集尿液:可减少污染,但易引起逆行感染,除非必要,须避免用此方法。对留置导尿者,可用碘酒消毒尿道口处的导尿管壁,用无菌注射器斜穿管壁抽吸尿液,或消毒后解开接口,弃去导尿管前段尿液,留无污染的膀胱内尿液送检。不可从集尿袋的下端管口留取标本。
3、膀胱穿刺采集尿液:病人耻骨上皮肤消毒后,以无菌针筒作膀胱穿刺。此法主要用于尿液厌氧菌培养或中段尿采集困难的婴幼儿。尿液标本采集后,应立即送检和处理,耽搁时间不能超过两小时,否则,应置4℃冰箱保存,但最好也不要超过6小时。 (三)痰液
1、自然咳痰:清水反复漱口后用力咳嗽, 从呼吸道深部咳出新鲜痰液于无菌容器内送检。痰量极少者可用45℃10%氯化钠液雾化吸入导痰,一般以清晨第一口痰为好。
2、气管镜下采集法、气管穿刺法:可减少污染,但病人有一定的痛苦,不易接受和推广。
3、痰标本采集后应及时送检和处理,最好不超过1小时,室温下延搁数小时,定植于口咽部的非致病菌呈过度生长,而肺炎链球菌,流感嗜血杆菌等的检出率则明显下降。
(四)伤口烧伤创面与脓液
1、无菌生理盐水清洗病灶表面后,用无菌拭子取病灶深部的脓液和分泌物, 立即送检,或置运送培养基内送检。
2、对未溃破的脓肿直接用碘酒,酒精消毒皮肤后,以无菌注射器抽取脓液送检,也可以切开排脓时用无菌拭子采样。
(五)粪便
1、挑取有脓血粘液部分的新鲜粪便约2-3克盛于灭菌容器中送检,也可用拭子挑取粪便插入Cary-Blair运送培养基或PH7.0的磷酸盐甘油中送检,可提高病原菌的检出率。
2、对不易获取粪便者,如婴幼儿可用直肠拭子采集送检。
三、标本的质量评估标准
1) 标本及送检单上应注明被检人的姓名、性别、年龄、临床诊断、标本来源及检验目的、抗生素使用情况等,无患者信息及标识的不予接收。 2) 标本须及时送检,超过时限的标本不予接收。 3) 送检容器须完整,有容器破损或标本渗漏的不予接收。 4) 标本储存、运送方式不当的,不予接收。 5) 明显被污染的标本不予接收。 6) 标本量明显不足的标本不予接收。
7) 除血培养之外的同一天内重复申请检验的标本不予接收。
四、临床病原体检查方法 其主要手段包括:
1. 直接显微镜检查:重要的基本方法,常作为初步诊断但阳性率相对较低。 2. 特异性抗原检查:可作为早期快速诊断,但特异性是关键。 3. 核酸检查:近年来发展迅速,敏感性和特异性均较好。 4. 病原菌分离培养和鉴定:常为确诊的关键步骤,但常较费时。 5. 血清学检查:通过检测相应的特异性抗体以辅助诊断。
第二节 病原体耐药性检测
一、抗生素治疗的现状和存在的问题
1) 抗生素使用增加,疗效下降 2) 出现难以治疗的感染 3) 抗生素加剧细菌耐药性 4) 抗生素引起菌群失调,二重感染 5) 抗生素滥用,污染造成危害
二、细菌产生耐药的主要机制
1) 细菌水平和垂直传播耐药基因的整合子系统 2) 产生灭活抗生素的水解酶和钝化酶 3) 细菌抗生素作用靶位的改变 4) 细菌膜外排泵出系统 5) 细菌生物膜的形成
三、目前必须密切注视的几个世界性的耐药性问题
1) 耐青霉素G的肺炎链球菌(PRSP) 2) 耐苯唑青霉素的葡萄球菌(MRS)和对万古霉素敏感性降低的MRS株 3) 耐万古霉素的肠球菌(VRE)、葡萄球菌 4) 产青霉素酶的淋球菌
5) 产超广谱β-内酰胺酶的肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌(ESBLS) 6) 多重耐药的铜绿假单胞菌、不动杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌
7) 持续高产染色体Ι型β-内酰胺酶的阴沟肠杆菌、产气肠杆菌、弗劳地枸橼酸杆菌
四、细菌的药物敏感试验 药敏试验的结果解释
1) 敏感(S):测试菌能被测定药物常规剂量给药后在体内达到的血药浓度所抑制或杀灭,即该菌引起的感染可以用推荐剂量(常规剂量)的该抗菌药物治疗。其体外的最低抑菌浓度(MIC)必须低于临床上该种抗菌药物的常规用量。
2) 中度敏感(I):测定菌能被测定药物大剂量给药后在体内达到的血药浓度所抑制,或在测定药物浓集部位的体液中被抑制。其细菌对这类抗菌药物的反应性通常低于敏感菌,中度敏感药物在生理浓集部位或高于常规剂量也可有临床疗效。 3) 耐药(R):测试菌不能被在体内感染部位可能达到的抗菌药物浓度所抑制,感染菌对该抗菌药物治疗不发生反应,即使加大剂量或药物浓集部位也不发生反应。
第三节 临床感染常见病原体检测
一、细菌感染
1. 检测细菌或其抗原:直接涂片镜检、培养、抗原检测与分析 2. 检测抗体 3. 检测细菌遗传物质 二.病毒感染
1.显微镜形态学检查:光镜检查特征性病毒包涵体,电镜检查病毒颗粒。 2.分离培养:活细胞培养-临床不常用,科研用。 3.血清学检查:临床常用,如HIV检查等。 4.核酸杂交和PCR方法:近年来发展迅速。 三.真菌感染
1.形态学检查:重要手段。 2.分离培养、鉴定。
3.抗原检查及血清学诊断:少用。 四.寄生虫感染 1.涂片检查:最可靠确诊方法,如粪便中找蠕虫卵、外周血中找疟原虫等。 2.免疫学诊断方法:广泛应用 。 3.DNA探针及PCR技术:近年发展迅速。 五.其他病原体感染检查
1.支原体检查:直接显微镜检查无临床意义,分离培养为确诊依据。
2.螺旋体检查:暗视野显微镜检查;钩端螺旋体可培养;血清学诊断为最主要方法。 3.衣原体检查:直接显微镜检查有参考价值;免疫学方法检测抗原或抗体为主要方法。 4.立克次体检查:直接检出(免疫荧光、PCR等);动物接种;血清学诊断试验(外斐试验等)。
第五节 性传播疾病病原体检测
性传播疾病(STD)是指以性行为为主要传播途径的一类传染病,通称性病。经典性病(VD)仅包括梅毒、淋病、软下甙、性病性肉芽肿4种。目前,国内外认为凡通过性行为传播的疾病,均称性病。其数量明显增多,包括:梅毒、淋病、非淋菌性尿道炎、软下疳、性病性淋巴肉芽肿、腹股沟肉芽肿、生殖器疱疹、尖锐湿疣、生殖器念珠菌病、传染性软疣、滴虫性阴道炎、疥疮、阴虱病、嗜血杆菌阴道炎、巨细胞病毒感染等。近来证实乙型肝炎和艾滋病病人的血液、精液或唾液中也有病毒,也能通过性行为传播,因而也被列入性传播疾病。
(一)艾滋病实验室检查
1.直接显微镜检查:电镜检查具有诊断价值,但临床应用较少。 2.PCR方法:RT-PCR为目前最敏感方法,亦为确诊试验。 3.病毒分离鉴定:临床少用,只用于实验室研究。
4.血清学诊断:最常用手段。常以ELISA法检测HIV抗体作为初筛试验,蛋白印迹试验为确诊试验。
(二)梅毒实验室检查
1.直接显微镜检查:暗视野显微镜检查,诊断早期梅毒快速、可靠方法。
2.PCR方法:敏感、特异的方法,适用于梅毒孕妇如羊水、新生儿血清、脑脊液标本。 3.血清学诊断:最常用手段。常以RPR(快速血浆反应素环状卡片试验)作为初筛试验,TPHA(抗梅毒螺旋体抗体间接血凝试验)作为确诊试验。
(三)淋病实验室检查 1.直接显微镜涂片检查:早期诊断,敏感性稍差,对男性患者特异性高而对女性患者特异性稍差。
2.PCR方法:早期、快速、敏感的方法,不能区别是活菌还是死菌。 3.分离培养和鉴定:特异性高,为诊断“金标准”,同时可作药敏试验。
(四)非淋菌性尿道炎实验室检查
1.衣原体检查:常用特异性抗原检查、培养等。
2.支原体检查:相关病原体主要是解脲脲原体与人型支原体,可进行培养,根据解脲脲原体分解尿素产氨、人型支原体分解精氨酸产碱使指示剂变色,需进行定量计数并同时可作药敏试验。
第六节 医院感染常见病原体检测
医院感染是指患者在入院时既不存在,亦不处于潜伏期,而在医院内发生的感染,包括医院内获得而在出院后发病的感染。即发生在医院中的一切感染。是当今医院的一个非常重要的问题。
一、医院感染的特点
1) 感染源和病原体:感染源主要来自住院患者、医务人员、探访人员以及医院环境、医疗器械、血液制品的污染等。最常见病原体是细菌,多以革兰阴性杆菌为主。 2) 易感人群:常见于免疫力低下状态的住院患者。
3) 常见临床类型:下呼吸道感染为最常见医院感染类型,其它如尿路感染、手术切口感染、胃肠道感染、血液感染、皮肤和软组织感染等亦多见。
二、医院感染监测主要包括以下几方面
1. 临床感染病原体的微生物学检测:临床对一切发生感染及可疑的病人,都应根据感染情况,采集血液、骨髓、尿液、痰液、粪便、脓液等标本进行微生物学检测,,一是为了临床治疗,二是满足医院感染流行病学调查的需要。
病毒核酸检测范文第5篇
本指导原则是针对基于核酸检测方法进行耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和金黄色葡萄球菌鉴别检测的体外诊断试剂的一般要求,申请人应依据产品的具体特性确定其中内容是否适用,若不适用,需具体阐述理由及相应的科学依据,并依据产品的具体特性对注册申报资料的内容进行充实和细化。
本指导原则是供申请人和审查人员使用的指导性文件,不涉及注册审批等行政事项,亦不作为法规强制执行,如有能够满足法规要求的其他方法,也可以采用,但应提供详细的研究资料和验证资料。应在遵循相关法规的前提下使用本指导原则。
本指导原则是在现行法规、标准体系及当前认知水平下制定的,随着法规、标准的不断完善和科学技术的不断发展,本指导原则相关内容也将适时进行调整。
一、适用范围 (一)临床背景 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)为革兰阳性球菌,是葡萄球菌属的一种,分布广泛,多种动物和人均有易感性,是临床上常见的致病菌。随着抗菌药物的使用,逐渐出现耐药型金黄色葡萄球菌,如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant staphylococcus aureus,MRSA)。MRSA具有多重耐药性,不仅对β-内酰胺类抗菌药物耐药,也对氨基糖苷类、大环内酯类、四环素类和喹诺酮类药物都表现出不同程度的耐药,其对不同抗菌药物的耐药率存在较大的地域差异,并有不同的变化趋势。
MRSA分为医疗机构相关性MRSA(healthcare-associated MRSA,HA-MRSA)、社区相关性MRSA ( community-associated MRSA,CA-MRSA )和家畜相关性(Livestock- associated MRSA,LA-MRSA)。CA-MRSA 和HA-MRSA 、LA-MRSA在微生物学、细菌耐药(如HA-MRSA相较于CA-MRSA表现出更多多重耐药)及临床特点方面(如感染部位)有较大差异,根据这些特点可以将两者进行区分。但由于人员在医院和社区间不断流动,CA-MRSA 和HA-MRSA 的差异日渐缩小。MRSA的分型有多种方式,如SCCmec、spa基因分型、多位点序列分型(MLST)、基于脉冲场凝胶电泳(PFGE)的分型等。
MRSA的耐药机制可能是由于MRSA受到外界刺激后本身固有耐药基因被激活或是引入了外来的耐药基因并激活。目前临床分离的MRSA菌株对大多数β-内酰胺抗菌药物耐药(新型头孢菌素类除外),大部分耐药是由mecA、mecC基因介导,但是小部分MRSA不携带mecA基因,存在其它耐药机制。
目前SA的临床检测方法包括:分离培养后,经染色观察、血浆凝固酶试验、生化鉴定,质谱鉴定及聚合酶链反应(PCR)检测耐热核酸酶(nuc)基因、SA保守基因16S rRNA和SA多种毒素基因。
MRSA的检测方法包括头孢西丁纸片扩散法、苯唑西林微量肉汤/琼脂稀释法(MIC)、苯唑西林琼脂筛选法、青霉素结合蛋白(PBP2a)乳胶凝集法、显色培养基法、自动化药敏检测以及聚合酶链反应(PCR)检测mecA等基因方法。
美国临床和实验室标准协会(CLSI)推荐用于MRSA的检测方法有:纸片扩散法、2%NaCl肉汤/琼脂稀释法和苯唑西林琼脂筛选法,这些检测方法均需要在33-35℃条件下孵育24小时。
目前临床推荐选择头孢西丁筛查试验进行MRSA的检测,还可以选择苯唑西林微量肉汤/琼脂稀释法(MIC)。
MRSA/SA的临床检测样本类型包括但不限于鼻拭子、痰液、皮肤及软组织感染样本、血培养阳性并革兰染色法阳性球菌的样品等人体样本和培养物。不同样本类型可能适用于不同的临床预期用途:如用于医疗机构对住院病人包括重症监护病人、手术病人及长期护理病人等MRSA院内感染的预防和控制的监测,用于结合其他实验室检测如微生物培养等辅助诊断MRSA/SA的感染,用于临床需进行培养检测的患者MRSA/SA感染的辅助诊断等。
(二)本指导原则适用范围 本指导原则适用于基于核酸检测方法进行耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和金黄色葡萄球菌鉴别检测的体外诊断试剂。常见方法包括荧光聚合酶链反应(PCR)方法、基因芯片法等。本指导原则的相关内容基于荧光聚合酶链反应(PCR)方法对产品相关申报资料提出要求,其他方法的相关产品可依据方法学的具体特点参照执行。
二、注册申报资料要求 (一)综述资料 综述资料主要包括产品预期用途、产品描述、有关生物安全性的说明、有关产品主要研究结果的总结和评价以及其他内容,其中,与预期用途相关的临床适应症应重点描述申报产品所检测的金黄色葡萄球菌鉴定基因的选择依据、耐药突变位点与耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的相关性、基因选择的依据及覆盖的耐药菌的情况、产品验证覆盖的耐药菌株及其在我国的流行特征;
产品描述应明确申报产品所有可检出的耐药基因型(可包含不同分型方式下的分型,如SCCmec型、spa型以及PFGE分型)、尚未验证的耐药菌株型别;
同类产品在国内外批准上市的情况,应着重从所检菌株覆盖情况、检测的最低检出限及不同菌株和型别间的交叉反应等方面写明拟申报产品与目前市场上已获批准的同类产品之间的主要区别。综述资料的撰写应符合《体外诊断试剂注册管理办法》(国家食品药品监督管理总局令第5号)和《体外诊断试剂注册申报资料要求及说明》(国家食品药品监督管理总局公告2014年第44号)的相关要求。
(二)主要原材料研究资料 此类产品主要为PCR方法,主要原材料包括引物、探针、DNA聚合酶、dNTP、尿嘧啶糖基化酶(如有)、核酸分离/纯化组分(如有)、试剂盒质控品及企业参考品等。应提供主要原材料的选择与来源、制备及质量标准等的研究资料、质控品的确认试验资料;
生产企业还应提供企业参考品的原材料选择、来源、质量指标、参考品的制备及阴阳性的确认过程等。
1.引物和探针:包括申报产品检测靶序列的引物和探针以及内对照的引物和探针。应详述引物和探针的设计原则,提供引物、探针核酸序列、模板核酸序列及两者的对应情况。针对检测靶序列的引物和探针,建议设计两套或多套引物、探针以供筛选,针对预期适用的型别进行检出准确性和特异性(如交叉反应)的评价,可采用扩增靶序列与SA和MRSA基因组比对研究的方法,最终确认最佳组合,并提交筛选的研究数据。引物、探针的质量标准应至少包括序列准确性、纯度检查、浓度检查及功能性实验等。
2.酶:需要的酶主要包括DNA聚合酶,其质量标准如下:
2.1DNA聚合酶应包括DNA聚合酶活性、无核酸内切酶活性、热启动能力(如适用)、热稳定性等。
2.2如申报产品中包含尿嘧啶DNA糖基化酶,应对其酶活性及热稳定性等质量控制标准进行规定。
3.dNTP:质量标准应至少包括纯度检查及功能性实验等。
4.核酸分离/纯化组分(如有)的原理介绍、主要组成、主要原材料的质量控制标准及相关验证资料。
5.试剂盒质控品 试剂盒的质控体系通过设置各种试剂盒质控品来实现,针对阳性质控品和阴性质控品,申请人应明确质控品的来源、质量标准、质控品阴阳性的确认方法及相关验证资料。质控品应参与样本处理和检测的全过程,如核酸的平行提取等步骤。申报产品的质控体系应考虑以下几个方面:
5.1阳性质控品中应含有包含试剂盒所检靶序列的DNA,优先使用MRSA/SA分离灭活菌株,也可以采用工程菌株、克隆菌株等。企业应对质控品的检测结果做出明确的范围要求(如Ct值)。
5.2阴性质控品应不含试剂盒所检靶序列的基因,阴性质控的基质应与实际样本基质一致或接近,以对可能存在的交叉污染产生的假阳性结果进行质量控制。
5.3对照(内标)可以对管内抑制导致的假阴性结果进行质量控制,申请人应对内对照(内标)的引物、探针设计和模板浓度做精确验证,既要保证内标荧光通道呈明显的阳性曲线又要尽量降低对靶基因检测造成的抑制。对内对照的检测结果亦应做出明确的范围要求(如Ct值)。
6.企业参考品:应详细说明有关企业参考品的原料选择、制备过程、提供阴阳性确认等试验资料。
企业参考品应充分考虑产品检测靶物质的各种基因型别和耐药菌株,考虑产品验证的性能需求进行设置。具体要求如下:
6.1阳性参考品 阳性参考品应采用经鉴定确认的多个临床流行分离菌株、含有菌株纯化的基因组DNA等,包含申报产品声称的应检出的MRSA/SA基因型。应覆盖我国主要的流行耐药菌株,可包含不同分型方式下的分型,如SCCmec型、spa型以及PFGE分型等。
6.2阴性参考品(特异性参考品) 阴性参考品应考虑检测MRSA和SA的特异性分别进行评价的要求,应纳入不在试剂盒检测范围内的其他葡萄球菌、革兰阳性菌菌株和其他病原体样品,特别是可能存在潜在竞争抑制的甲氧西林敏感凝固酶阴性葡萄球菌。
6.3检测限参考品 检测限参考品应分别针对MRSA和SA每个分析物靶基因和不同样本类型设定检测限附近连续稀释的参考品,应使用处于对数增长期的菌进行制备,明确每个参考品的活菌数,以CFU/mL表示。应明确CFU的确定方法。
6.4精密度参考品 精密度参考品应使用菌株针对每个检测目标物设定一组参考品,包括阴性、弱阳性(略高于临界值,预期重复检测95%阳性)、中等阳性(高于临界值,预期检测结果100%阳性)三个水平。
如产品适用于不同的样本类型,建议针对不同样本类型设定不同的参考品基质,应与实际样本类型基质一致或相似,模拟基质应经证实与天然基质无显著差异。
若主要原材料为企业自己生产,其生产工艺必须相对稳定,并提交主要原材料制备过程;
如主要原材料购自其他供应商,则需针对供应商的选择提供评价数据,并提供供应商出具的质量标准、出厂检定报告,以及申请人对该原材料进行的质量检验资料。
(三)主要生产工艺及反应体系的研究资料 1.介绍产品主要生产工艺,可以图表方式表示,并说明主要生产工艺的确定依据。
2.反应原理介绍。
3.详述样本采集、样本处理方式的选择和设置,提供相关的研究资料。
4.确定最佳反应体系的研究资料,包括样本用量、各种酶浓度、引物/探针浓度、dNTP浓度、阳离子浓度及反应各阶段温度、时间、循环数等。
5.不同适用机型的反应条件如果有差异应分别详述,并提交验证资料。
6.如申报产品包含核酸分离/纯化试剂,应提交对核酸分离/纯化过程进行选择的研究资料。
(四)分析性能评估资料 申请人应提交产品研制阶段对试剂盒进行的所有性能评价的研究资料,对于每项分析性能的评价都应包括具体研究目的、试验方法、可接受标准、试验数据、统计方法等详细资料。有关分析性能验证的背景信息也应在申报资料中有所体现,包括实验地点、适用仪器、试剂规格、批号和临床样本来源等。
针对不同的样本类型如鼻拭子、痰液、皮肤和软组织感染拭子样本、血培养分离样本等,申请人应分别完成性能评估,包括阴阳性符合率、最低检测限、精密度评价、干扰验证等。
分析性能评价的试验方法可以参考相关的国外或国内有关体外诊断试剂性能评估的指导原则进行。各项性能评价应符合以下要求。
1.核酸分离/纯化性能(如适用) 在进行靶核酸检测前,应有适当的核酸分离/纯化步骤。该步骤的目的除最大量分离出目的核酸外,还应有相应的纯化作用,尽可能去除PCR抑制物。无论检测试剂是否含有核酸分离/纯化的组分,企业都应结合检测试剂的特性,对配合使用的核酸分离/纯化试剂针对声称样本类型的提取效率、提取核酸纯度等做充分的验证,提供详细的验证资料。
2.最低检测限 申报产品最低检出限的性能评估资料应包含最低检出限的确定及验证过程。
应使用临床分离获得的特征良好的MRSA/SA分离菌株进行最低检测限研究。所选菌株建议包含来自不同地区的MRSA/SA,以涵盖金黄色葡萄球菌的遗传多样性,应覆盖不同分型方式下的不同分型,如SCCmec型、spa型、PFGE分型,涵盖我国不同地区临床常见型别。最低检测限的确定研究试验应使用上述选定的多种有代表性的MRSA/SA分离菌株进行连续稀释,以CFU/mL为检测单位,如引入DNA拷贝数作为单位,应确定两者之间的换算关系。稀释基质应根据产品声称的样本类型分别配合相应的基质。如样本类型为鼻拭子、痰液或皮肤及软组织感染拭子,建议使用阴性鼻拭子或阴性皮肤及软组织拭子洗液或模拟基质进行稀释,如可使用含生理盐水、粘蛋白及人类基因组DNA的基质作为鼻拭子、痰液样本替代基质,使用含白细胞、红细胞、血浆的基质作为皮肤及软组织拭子样本的替代基质;
如样本类型为经血培养并确定含革兰阳性球菌(GPC)的样本,应使用含人血液和适配的血液培养基作为模拟基质,并应添加高浓度的常见感染菌。可将模拟样本稀释液培养一段时间。无论使用何种模拟或替代基质,应进行基质比对性试验证明替代基质与临床实际样本的等效性。
将各稀释液重复检测3-5次,预估检测限范围后制备至少20份检测限浓度样本,证实MRSA/SA检出率达到95%的浓度作为最低检测限。针对不同的血培养瓶或血培养系统,应分别验证检测限是否一致。
3.包容性 应通过实验证实产品能够检出的金黄色葡萄球菌中存在的基因多态性的MRSA/SA。在实验验证菌株纳入时考虑金黄色葡萄球菌的进化结构,常见克隆系和型别,并纳入不同SCCmec型、spa型、PFGE类型的菌株。建议检索近年国内相关文献报道并收集各地区、不同菌株(社区和医院内感染,鼻腔、皮肤和软组织感染等)进行菌株验证。被验证细菌的浓度应接近检测限水平,所有菌株应进行鉴定和浓度测定。并应在预期可能存在高浓度(高于106CFU/mL)的其他感染菌如甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)和耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌情况下进行试验。
4.申请人应对申报产品精密度指标做出合理要求。精密度评价使用菌株配制的企业参考品或相应临床样本进行,且精密度评价试验应包含核酸分离/纯化步骤。针对本类产品的精密度评价主要包括以下要求。
4.1对可能影响检测精密度的主要变量进行验证,除检测试剂(包括核酸分离/纯化组分)本身的影响外,还应对分析仪、操作者、地点、检测批次等要素进行相关的验证。
4.2设定合理的精密度评价周期,例如:为期至少20天的检测,每天至少由2人完成不少于2次的完整检测,从而对批内/批间、日内/日间以及不同操作者之间的精密度进行综合评价。
4.3用于精密度评价的参考品或临床样本均应至少包含3个水平:阴性、弱阳性(略高于临界值,预期重复检测95%阳性)、中等阳性(高于临界值,预期检测结果100%阳性),并根据产品特性设定适当的精密度要求,临床样本精密度评价中的每一次检测均应从核酸提取开始。
5.分析特异性 5.1交叉反应 交叉反应的验证应结合样本来源进行,针对不同样本类型考虑可能共生的潜在的交叉反应病原体。应使用高浓度交叉反应病原体(如高于106CFU/mL的细菌和酵母,高于105PFU/mL的病毒)进行交叉反应验证,以明确是否存在交叉反应所致的假阳性。
针对鼻拭子、痰液样本,应考虑在鼻中及呼吸道的致病菌和共生菌,如甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)、凝固酶阴性葡萄球菌、耐甲氧西林表皮葡萄球菌(MRSE),以及革兰阴性杆菌、革兰阴性球菌、奈瑟菌、莫拉菌、酵母菌、革兰阳性杆菌、革兰阳性球菌等临床常见菌种,凝固酶阳性葡萄球菌代表菌株。
针对皮肤和软组织感染样本或检测来自血培养测定为阳性微生物生长并经革兰染色证实为革兰阳性球菌的样本,应纳入更多微生物,包括皮肤菌群。对于血培瓶来源的样本无必要进行病毒交叉反应验证。
5.2微生物干扰 同样采用上述潜在交叉反应微生物,评价潜在微生物干扰,即是否对MRSA/SA临界水平样本检测产生干扰。建议采用存在于各标本类型的(鼻拭子、痰液、皮肤和软组织感染、血培养样本)和代表不同MRSA基因型的至少两个MRSA菌株在临界水平进行微生物干扰试验。
5.3干扰物质 评价各样本类型中可能存在的干扰物质是否对检测造成干扰。建议采用存在于各标本类型的(鼻拭子、痰液、皮肤和软组织感染、血培养样本)和代表不同MRSA基因型的至少两个MRSA菌株的临界浓度对干扰物质(潜在最高浓度)进行验证。鼻拭子样本的干扰物质应考虑血液、鼻腔分泌物或黏液、鼻腔用药。痰液样本的干扰物应考虑如血液、粘液、人细胞等。皮肤和软组织感染样本的潜在干扰物应考虑血液、脓液、血浆、常用外用抗菌药、抗生素等皮肤用药。血培养样本的潜在干扰物质应考虑血培养基、树脂及活性炭等,具体结合培养瓶类型确定。
6.阳性/阴性参考品符合率 阳性参考品的检测旨在验证试剂盒检测范围内的MRSA/SA均可以在适当的浓度被检测到,阳性参考品检测结果应为阳性。阴性参考品旨在评价试剂特异性,阴性参考品检测结果应为阴性。
7.方法学比对研究 为验证拟申报产品靶核酸检测的准确性,应选择部分临床样本将拟申报产品与已上市核酸检测试剂进行比较研究。所选对比试剂检测靶基因应与拟申报试剂一致,方法性能可比,且临床公认质量较好;
对于无已上市核酸检测试剂的目的基因,可与病毒核酸序列测定方法进行比对。用于核酸序列测定的引物序列应不同于考核试剂中用于检测目的基因的引物序列。建议对扩增子进行双向测序。方法学比对研究的具体方式可参考相关的国外或国内有关的指导文件进行,临床样本数量及其特性应具有代表性,能够充分验证拟申报产品靶核酸检测的准确性。
8.其他性能研究(如涉及) 如携带污染的验证,使用高阳性样本和阴性样本交叉检测多次运行,考察设备多样本检验是否存在携带污染。
(五)阳性判断值确定资料 对于此类试剂,阳性判断值即为针对每个目标物能够获得理想的临床灵敏度和临床特异性的临界值(Cutoff),对于荧光探针PCR方法即为Ct值的确定资料。建议采用受试者工作特征(ROC)曲线的方式进行相关研究。申请人应选取适当的足够数量的临床样本进行试验以确定阳性判断值。
(六)稳定性研究资料 稳定性研究资料主要涉及两部分内容,申报试剂的稳定性和适用样本的稳定性研究。前者主要包括实时稳定性(有效期)、开瓶稳定性及冻融次数限制等研究,申请人可根据实际需要选择合理的稳定性研究方案。稳定性研究资料应包括研究方法的确定依据、具体的实施方案、详细的研究数据以及结论。对于实时稳定性研究,应提供至少三批样品在实际储存条件下保存至成品有效期后的研究资料。
样本稳定性进行研究,可以在合理的温度范围内,每间隔一定的时间段即对储存样本进行全性能的分析验证,从而确认不同类型样本的效期稳定性。冷冻保存的样本还应对冻融次数进行评价。
对于样本提取后不能立即进行检测的,应明确核酸储存条件、储存时间等内容,同时应提供相应的核酸稳定性研究资料。
试剂稳定性和样本稳定性两部分内容的研究结果均应在说明书【储存条件及有效期】和【样本要求】两项中进行详细说明。
(七)产品风险分析资料 申请人应参考YY/T 0316《医疗器械 风险管理对医疗器械的应用》规定的过程和方法,在产品生命周期内对申报产品可能造成的危害进行判定(可重点参考YY/T 0316的附录H),对每一危害处境的风险进行判定和评价,形成风险管理报告,控制这些风险并监视控制的有效性,充分保证产品的安全性和有效性。
该试剂的主要危害大致可包括三个方面,即:生物学和化学危害、操作危害、信息危害。
1.生物学和化学危害 生物学:如细菌、病毒引起的交叉感染、检测完成后剩余样本、试剂和废弃物处理不当引起的交叉感染。
化学:如使用的清洁剂、消毒剂残留引发的危害。
2.操作危害 不正确的测量:
如未按使用说明书中的要求进行测量,造成的测量失败、测量误差过大。
使用未经验证的不同厂家的分析仪或使用未经正确保养或校准的仪器,造成的测量失败、测量误差过大。
在制造商规定的使用环境条件外使用产品,可能造成测量误差过大。
3.信息危害 如说明书或标签缺少或不正确,标记的位置不正确,不能被正确的识别,不能清楚易认。
不符合法规及标准规定的产品说明书,包括产品说明书中未对限制充分告知,未对不正确的操作、与其他设备共同使用时易产生的危害进行警告,未正确标示储存条件、消毒方法、维护信息,未对因长期使用产生功能丧失而可能引发的危害进行警告,未对合理可预见的误用进行警告等引发的危害。
(八)临床评价资料 临床试验的开展、方案的制定以及报告的撰写等均应符合相关法规及《体外诊断试剂临床试验技术指导原则》(国家食品药品监督管理总局通告2014年第16号)的要求。
1.研究方法 建议采用前瞻性临床试验对拟申报产品进行临床评价,以SA和MRSA鉴定和药敏检测临床参考方法作为对照方法,金黄色葡萄球菌鉴定应结合形态学、凝固酶试验和生化鉴定、质谱方法等方法,药敏方法建议使用头孢西丁纸片法或苯唑西林微量肉汤/琼脂稀释法(MIC),也可以应用相应的全自动鉴定药敏方法,证明拟上市产品的临床性能和预期用途。针对不同样本类型对应的不同预期用途,分别设计临床试验进行研究。
2.临床试验病例数 临床试验样本量应满足统计学要求,可采用适当的统计学方法进行估算。本临床试验的主要评价指标为拟申报产品相对于临床参考方法的灵敏度和特异性。
临床总体样本量应分别考虑SA和MRSA阳性和阴性样本量的统计需求,综合估算。SA和MRSA的临床试验阳性样本例数的估算建议采用单组目标值法,考核试剂的SA鉴定和MRSA药敏检测灵敏度目标值建议针对不同样本类型设置,建议鼻拭子、痰液、皮肤软组织拭子等直接样本的目标值不低于90%,血培养样本目标值不低于95%。通过参数估计(含相应可信区间估计)的方法证明产品针对SA鉴定和MRSA药敏检测的灵敏度不低于目标值,可参考如下样本量公式计算。
n=Z1-α/2P01-P0+Z1-βPT1-PT2PT-P02 公式中,n为样本量;
Z1-α/2、Z1-β为标准正态分布的分数位,P0为评价指标的目标值,PT为试验用体外诊断试剂评价指标预期值。
SA和MRSA的阴性样本量的估算可不采用目标值法,建议根据预实验获得的特异度的预期值采用如下公式计算:
n=Z1-α/22P(1-P)Δ2 公式中n为样本量,Z1-α/2为标准正态分布的分位数,P为评价指标预期值,Δ为P的允许误差大小,一般取P的95%可信区间宽度的一半,常用的取值为0.05-0.1。
同时总体样本确定时应考虑到培养鉴定的成功率、其他可能造成样本脱落的情况以及可能需要纳入的干扰等适当增加样本量。如不同样本类型适用不同预期用途,针对每一种预期用途临床试验总病例数均应分别满足统计学要求。
3.临床研究单位的选择 应选择不少于3家(含3家)临床试验机构,按照相关法规、指导原则的要求开展临床试验。临床试验机构的选择应尽量考虑拟申报产品的特点和预期用途,综合流行病学背景,鉴于不同地区及医疗机构中SA/MRSA流行情况的差异,应选择不同地区的临床试验机构开展临床试验,不得选择同一地区地域相近的医疗机构进行临床试验。且临床试验机构应具有分子生物学方法检测的优势,实验操作人员应有足够的时间熟悉检测系统的各环节,熟悉评价方案。
4.病例选择及样本类型 临床试验病例选择应根据产品声称预期用途中使用的样本类型及适用人群进行选择,如临床背景内容中所述,该产品适用不同样本类型时对应不同的临床预期用途,采用鼻拭子样本的试剂用于MRSA院内感染的预防和控制时,应采用医疗机构中的住院病人包括重症监护病人、手术病人及长期护理病人等病例进行临床研究;
皮肤及软组织感染拭子用于结合其他实验室检测如微生物培养等辅助诊断MRSA/SA的皮肤和软组织感染时,应采用临床皮肤和软组织感染病例进行临床研究;
血培养测定为阳性微生物生长并显示包含由革兰染色法产生的革阳性球菌(GPC)的样本用于临床需进行血培养检测的患者MRSA/SA感染的辅助诊断时,应采用临床需进行血培养检测的患者,且血培养测定为阳性微生物生长并显示包含由革兰染色法产生的革兰阳性球菌的患者作为病例进行临床研究。同时适用于上述不同样本类型时,应分别进行相关病例的临床研究。
申请人在建立病例纳入标准时,应综合考虑到试剂所适用的各类人群的潜在差异,如年龄、性别、病情等。
同时应关注样本中其他病原体的存在情况、内源和外源干扰因素。
5.伦理学要求 临床试验必须符合赫尔辛基宣言的伦理学准则,必须获得临床试验机构伦理委员会的同意。研究者应考虑临床试验用样本的获得和试验结果对受试者的风险性,应提交伦理委员会的审查意见。
6.临床试验方案 临床试验实施前,研究人员应从流行病学、统计学、临床医学、检验医学等多方面考虑,设计科学合理的临床研究方案。各临床研究机构的方案设置应基本一致,且保证在整个临床试验过程中遵循预定的方案实施,不可随意改动。整个试验过程应在临床研究机构的实验室内并由本实验室的技术人员操作完成,申报单位的技术人员除进行必要的技术指导外,不得随意干涉实验进程,尤其是数据收集过程。
试验方案中应确定严格的病例纳入/排除标准,任何已经入选的病例再被排除出临床研究都应记录在案并明确说明原因。在试验操作过程中和判定试验结果时应采用盲法以保证试验结果的客观性。各研究单位选用的参比试剂应一致,以便进行合理的统计学分析。
7.统计学分析 对临床试验结果的统计应选择合适的统计方法,如检测结果一致性分析、临床灵敏度、特异度等。常选择2×2表的形式总结两种方法的定性检测结果。在临床研究方案中应明确统计检验假设,即评价考核试剂与参比方法是否等效的标准。灵敏度结果的95%置信区间下限应高于目标值。特异性结果与预期值差异应有明确可接受标准,如差异较大,应有合理的解释或继续扩大样本量。应分别对SA和MRSA的检测结果进行比较统计和分析。
对于不一致样本,应在方案中明确是否需进一步复测或确认,并对不一致原因进行分析。
8.质量控制 临床试验开始前,建议进行临床试验的预试验,以熟悉并掌握相关试验方法的操作、仪器、技术性能等,最大限度控制试验误差。整个试验过程都应处于有效的质量控制下,最大限度保证试验数据的准确性及可精密度精密度。
9.临床试验总结报告撰写 根据《体外诊断试剂临床试验技术指导原则》的要求,临床试验报告应该对试验的整体设计及各个关键点给予清晰、完整的阐述,应该对整个临床试验实施过程、结果分析、结论等进行条理分明的描述,并应包括必要的基础数据和统计分析方法。建议在临床总结报告中对以下内容进行详述。
9.1临床试验总体设计及方案描述 9.1.1临床试验的整体管理情况、临床研究单位选择、临床主要研究人员简介等基本情况介绍。
9.1.2病例纳入/排除标准、不同年龄段人群的预期选择例数及标准、盲态检测要求等。
9.1.3样本类型,样本的收集、处理及保存等。
9.1.4统计学方法、统计软件、评价统计结果的标准。
9.2 具体的临床试验情况 9.2.1临床试验所用体外诊断试剂及仪器的名称、批号、机型等信息。
9.2.2对各研究单位的病例数、年龄分布情况分布情况进行综合,建议以列表或图示方式列出各年龄组的样本例数。
9.2.3质量控制,试验人员培训、仪器日常维护、仪器校准、质控品运行情况。
9.2.4具体试验过程,样本收集、样本保存、样本检测、结果处理、结果不一致样本的确认等。
9.3统计学分析 9.3.1数据预处理、差异数据的重新检测或第三方验证以及是否纳入最终数据统计、对异常值或缺失值的处理、研究过程中是否涉及对方案的修改;
9.3.2结果的一致性分析 计算阳性符合率、阴性符合率、总体符合率,采用适当的统计学方法,如四格表卡方检验或kappa检验以验证两种试剂定性结果的一致性。
9.4讨论和结论 对总体结果进行总结性描述并简要分析试验结果,对本次临床研究有无特别说明,最后得出临床试验结论。
9.5其他 临床试验中如涉及核酸序列测定方法,应在临床研究报告中对选用的测序方法做详细介绍,并提供以下关于测序试验的详细信息及资料。
9.5.1测序方法原理、测序仪型号、测序试剂及消耗品的相关信息。
9.5.2测序方法所用引物相关信息,如基因区段选择,分子量、纯度、功能性试验等资料。
9.5.3对所选测序方法的分析性能进行合理验证,尤其是最低检测限的确认,建议将所选测序方法与拟申报产品的相关性能进行适当比对分析。
9.5.4测序方法应建立合理的阳性质控品和阴性质控品对临床样本的检测结果进行质量控制。
9.5.5提交有代表性的样本测序图谱及结果分析资料。
(九)产品技术要求 申请人应当在原材料质量和生产工艺稳定的前提下,根据申请人产品研制、前期临床评价等结果,依据国家标准、行业标准及有关文献,按照《医疗器械产品技术要求编写指导原则》(国家食品药品监督管理总局通告2014年第9号)的有关要求,编写产品技术要求。
该试剂的产品性能指标应主要包括:物理性状、阴/阳性参考品符合率、精密度、最低检测限等。性能指标应依据分析性能评估试验结果确定,检验方法应明确具体操作方法和使用的样本及参考品情况。
该产品为第三类体外诊断试剂,申请人应按照《医疗器械产品技术要求编写指导原则》的要求,以附录形式明确主要原材料、生产工艺及半成品要求,附录的编制应符合相关编写规范的要求。
(十)产品检验报告 应提供该产品符合产品技术要求的,在具有相应医疗器械检验资质和承检范围的医疗器械检验机构进行的产品检验报告;
应提供连续3个生产批次样品的检验合格报告。
(十一)产品说明书 说明书承载了产品预期用途、标本采集及处理、检验方法、检验结果解释以及注意事项等重要信息,是指导实验室工作人员正确操作、临床医生针对检验结果给出合理医学解释的重要依据,因此,产品说明书是体外诊断试剂注册申报最重要的文件之一。产品说明书的格式应符合《体外诊断试剂说明书编写指导原则》(国家食品药品监督管理总局通告2014年第17号)的要求,进口体外诊断试剂的中文说明书除格式要求外,其内容应尽量保持与原文说明书的一致性,翻译力求准确且符合中文表达习惯。产品说明书中相关技术内容均应与申请人提交的注册申报资料中的相关研究结果保持一致,如某些内容引用自参考文献,则应以规范格式对此内容进行标注,并单独列明文献的相关信息。
结合《体外诊断试剂说明书编写指导原则》的要求,下面对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和金黄色葡萄球菌鉴别和检测的体外诊断试剂说明书的重点内容进行详细说明,以指导注册申报人员更合理地完成说明书编制。
1.【预期用途】 1.1试剂盒用于定性检测人鼻拭子、痰液、皮肤及软组织感染拭子、血培养测定为阳性微生物生长并显示包含由革兰染色法产生的革兰阳性球菌的样品等样本的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和金黄色葡萄球菌,适用样本类型应结合实际的临床研究完成情况进行确认。
1.2明确试剂不同样本类型的临床意义,如鼻拭子样本用于医疗机构对住院病人包括重症监护病人、手术病人及长期护理病人等MRSA院内感染的预防和控制;
皮肤及软组织感染拭子用于结合其他实验室检测如微生物培养等辅助诊断MRSA/SA的皮肤和软组织感染;
血培养测定为阳性微生物生长并显示包含由革兰染色法产生的革兰阳性球菌的样本用于临床需进行血培养检测的患者MRSA/SA感染的辅助诊断等。
1.3SA和MRSA流行特征介绍。
1.4简单介绍待测目标的特征,如待测靶基因特征及与SA和MRSA的关系等。
2.【检验原理】 详细说明试剂盒技术原理,即核酸分离/纯化方法、原理。说明检测的靶基因座位、序列长度等;
介绍引物及探针设计、不同样品反应体系(管)组合、对照品(质控品)设置及荧光信号标记等。如添加了相关的防污染组分(如尿嘧啶DNA糖基化酶,即UDG/UNG等),也应对其作用机理作适当介绍。
3.【主要组成成分】 详细说明试剂盒内各组分的名称、数量、成分、浓度等信息,如含有生物源性物质,应说明其生物学来源、活性及其他特性;
说明不同批号试剂盒中各组分是否可以互换。
试剂盒中不包含但对该项检测必须的组分,应列出相关试剂的生产企业、产品名称、货号以及医疗器械注册证号/备案号(如有)等详细信息。当试剂盒中不包含用于核酸分离/纯化的试剂组分时,应在此注明经验证后推荐配合使用的商品化核酸分离/纯化试剂盒的如上信息。
4.【储存条件及有效期】 试剂盒的效期稳定性、开瓶稳定性、复溶稳定性、冻融次数要求等,应与相应的稳定性研究结论一致。
5.【适用仪器】 所有适用的仪器型号,提供与仪器有关的重要信息以指导用户操作。
6.【样本要求】 明确适用的样本类型。并详细描述样本采集及预处理要求、运输要求、保存条件及期限等。特别是样本采集所需设备及保存液,需特别明确供应商、货号及注册证号(如有)。有关描述均应建立在相关性能评价及稳定性研究的基础上。
样本的取材及处理方式等若有通用的技术规范或指南,则应遵循,并在此处引用。
7.【检验方法】 详细说明实验操作的各个步骤,包括:
7.1试剂配制方法、注意事项。
7.2核酸分离/纯化的条件、步骤及注意事项。对照品(质控品)参与样本核酸的平行提取的要求等。
7.3扩增反应前准备:各组分加样体积、顺序、相关注意事项等。
7.4 PCR各阶段的温度、时间设置、循环数设置及相关注意事项。
7.5仪器设置:特殊参数,待测基因、内标的荧光通道选择等。
7.6质量控制:说明对照品(质控品)的检测要求。
8.【阳性判断值】 简要总结阳性判断值研究方法及结论。明确说明样本的阳性判断值。
9.【检验结果的解释】 说明对照品、内标的正确结果要求,结合对照品(质控品)以及样本管中靶基因和内标的检测结果,对所有可能出现的结果组合及相应的解释进行详述。检验结果的解释应以阳性判断值的研究结论为依据。
10.【检验方法的局限性】 应至少包括如下描述:
10.1本试剂检测结果应结合患者临床症状及其他相关医学检查结果进行综合分析,不得单独作为患者管理的依据。
10.2基因检测结果仅能覆盖耐药机制为相应基因(如mecA基因和或mecC)的耐药结果,但是小部分MRSA不携带mecA和/或mecC基因,存在其它耐药机制,可能出现漏检。
10.3不合理的样本采集、转运及处理以及不当的实验操作和实验环境均有可能导致假阴性或假阳性结果。
11.【产品性能指标】 详述分析性能评估的试验结果并简要描述临床试验的基本信息、试验方法和结论。
12.【注意事项】 应至少包括以下内容:
12.1如该产品含有人源或动物源性物质,应给出生物安全性的警告。
12.2临床实验室应严格按照《医疗机构临床基因扩增实验室管理办法》(卫办医政发〔2010〕194号或现行有效版本)等有关分子生物学实验室、临床基因扩增实验室的管理规范执行。
12.3强调产品性能仅针对声称的适用样本类型及【样本要求】项下说明的样本采集和处理方法(包括样本采集液等)进行了验证,其他样本类型或样本采集、处理方法不能保证产品性能。
12.4强调实验操作人员应接受过基因扩增或分子生物学方法检测的专业培训,具备相关的实验操作资格,实验室应具备合理的生物安全防备设施及防护程序。
病毒核酸检测范文第6篇
0 2020 核酸检测应急预案
(通用)
为深入贯彻落实习近平总书记重要讲话指示批示精神,落实中央应对疫情工作领导小组和国务院联防联控机制部署, 按照省、市、区工作要求, 坚持预防为主, 发挥核酸检测支撑作用, 积极应对秋冬季可能新出现的新冠肺炎疫情,避免因局部疫情出现甚至暴发时, 医疗资源挤兑导致检测能力严重滞后, 给疫情防控和群众健康带来不利影响, 我街道结合辖区实际, 为做好大规模核酸采样准备工作, 特制定本预案。
一、
总体原则
坚持预防为主, 将加快提升核酸检测能力、尽力扩大核酸检测范围作为常态化防控落实“四早”措施的首要举措。
应急预案启动时, 落实加快提升检测能力所需的人员、设备和资金, 压实各部门、各社区责任, 完善大规模核酸检测工作机制。
二、
成立应急处置领导小组
成立 XX 区 XX 街道应对秋冬季新冠肺炎疫情核酸检测应急处置领导小组, 由街道党工委副书记、办事处主任 XX 任组长, 办事处副主任 XX 任常务副组长, 负责该预案的启动和实施, 应对出现新疫情时需要进行( 较)
大规模核酸检测的应急处置工作。
三、
建立网格化核酸采样机制
1.科学确定网格化检测区域划分。
按照属地管理原则,对可能
出现的全员核酸检测做好准备。
我街道定为 一级网格, 六个社区定为二级网格, 二级网格下按照小区、聚居地进一步划分为三级网格; 三级网格下按照小区每栋楼每座房子进一步划分为四级网格。
街道设置全员核酸检测工作领导小组, 负责辖区全员核酸检测工作, 包括人员动员、组织、公告、等工作, 每个二级网格设置全员核酸检测工作小组,按照“1+8”标准配备工作人员, 即有 1 名街道班子成员负责, 并设置 8 人专门小组,包括 1 名联络人、1 名医务人员、1 名信息登记员、1 名网络员、2 名引导员、1 名民警、1 名社区工作者; 二、三、四级网格由街道进一步进行划分, 并设置具体网格联络人, 负责网格内人员的组织、动员等工作; 各级网格需掌握网格内所有人员的相关详细信息, 包括姓名、性别、年龄、身份、身份证号码、住址、联系电话等, 确保在进行核酸检测时可及时通知动员到位。
针对行动不便的老人、孕产妇、残疾人等特殊群体, 组织安排采样人员上门采集, 确保检测工作全覆盖, 做到不落一人 。
2.建立核酸检测信息化管理系统。
街道卫健办负责与区数字办对接, 将摸底的辖区内人员信息按照网络化核酸检测要求提前录入系统, 做好人员信息的核对和审查, 实行动态更新,确保核酸检测工作准确、快捷、高效和报告查询便利。
3.选定核酸检测采样点。
各社区分别设置 1 个采样点,每个采样点配备 3 个采样帐篷。
提前储备好设置采样点所需的物资, 确保收到指令后能够迅速布置好采样点。
卫健办和 XX 街道社区卫生
服务中心要做好采样点设置的指导工作。采集点要求。
采样点要求选择空旷、通风、平坦、安全的区域, 根据原有场地条件, 划分为等候区、采集区、缓冲区、采集辅助区和临时隔离区, 有效分散待检人员密度; 需设立清晰的指引标识, 并明确采样流程和注意事项, 做好预案; 应当设置急救设备备用。
等候区。
设立独立的等候区域, 应设置人行通道和“1 米线”标识, 落实“1 米线”间隔要求, 尽可能保证人员单向流动,严控人员密度, 避免大规模采样时造成人员聚集; 等候人员均应按要求佩戴好口罩。采集区。
应根据气候条件, 配备帐篷、冷/暖风扇、适量桌椅, 保证医护人员在相对舒适环境下工作; 标本如无法及时运送至实验室, 需准备 4℃冰箱或低温保存箱暂存。缓冲区。
可提供采集人员更换个人防护装备。采集辅助区。
空间应当相对密闭, 用于采集人员更衣、备餐、值班等。
。
临时隔离区。
用于暂时隔离在采集过程中发现的疑似患者或高危人群。
4.组建核酸检测采样应急队伍。
综合秋冬季可能出现的疫情情况, 充实核酸采样力量, 做好相关专业人员储备。
依托 XX 街道社区卫生服务中心, 组建 1 支 XX 核酸采样应急队, 每个社区设置 3 个采样组, 每个采样组 3 个采样工作人员, 核酸采样应急队由区指挥部统一调度, 每支采样队设队长 1 名,每个采样小组设组长 1 名。
采样工作分上午 4 小时、下午 4 小时、晚上 4 小时每天共 12 小时轮班, 要求各社区制定全员核酸检测方案, 细化到每
天, 每个时间段具体采样的小区的楼栋和人数, 原则上 4 天内基本完成全员采样, 第五天做漏检补采。
采样人员防护装备要求:N95 及以上防护口罩、护目 镜、防护服、乳胶手套、防水靴套; 如果接触患者血液、体液、分泌物或排泄物, 戴双层乳胶手套; 手套被污染时, 及时更换外层乳胶手套。
每采一个人应当进行严格手消毒或更换手套。
5.做好被 采样人员安排准备。
核酸检测工作小组应根据指令做好被采样人员的安排, 迅速有序地组织网格内的人群按 5 人或 10 人一组提前做好采样准备, 采样过程中应注意做好个人防护。
我街道提前准备各个网格核酸样本采集后的样本转运车辆、人员, 并在辖区内准备 1 家酒店用于采样和送样人员洗漱。5 四、
加强组织保障
1.加强组织领导。
坚持人民至上、生命至上, 树牢以人民为中心的发展思想, 将全员核酸检测准备工作作为当前常态化疫情防控工作的重要内容, 要按照我区应对秋冬季新冠肺炎疫情应急预案开展应急演练, 开展全员核酸检测时, 要将每日 新冠病毒核酸检测情况及时报区指挥部。
2.做好物资储备。
街道指挥部物资采购组根据每日 检测量需求按照 3 个月 用量测算并储备人员防护物资。
3.加大宣传引导。
要进一步加强新冠肺炎防控知识的科普宣传工作, 压紧压实四方责任, 每个网格全员核酸检测工作小组具体负责,做好辖区内、网格内群众的宣传动员工作,有序组织群众分片
区进行核酸采样工作, 避免出现混乱、恐慌和人员聚集等现象。
4.加强督导检查。
进一步强化责任落实, 街道新冠肺炎防控工作应急指挥部组建督导检查专班, 对各社区工作落实情况进行督查。
各社区对检查发现的问题要立即进行整改,对责任落实不到位、不担当不作为的,要依纪依规严肃处理。
篇二:
2020 核酸检测应急预案
2 2
一、
目的
为贯彻落实《国务院应对新型冠状病毒肺炎疫情联防联控机制综合组关于进一步加快提高医疗机构新冠病毒核酸检测能力的通知》 (联防联控机制综发[2020]204 号), 进一步做好常态化新冠肺炎疫情防控, 有序提升我县新冠病毒核酸检测能力, 应对可能发生的疫情新情况, 扩大检测范围, 切实做好新型冠状病毒的防疫防控工作, 阻击疫情, 根据我县实际情况制定本预案。
二、
依据
本预案依据《中华人民共和国传染病防治法》 、《关于进一步做好新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控工作的通知》 、《突发公共卫生事件应急条例》 、《国务院应对新型冠状病毒肺炎疫情联防联控机制综合组关于进一步加快提高医疗机构新冠病毒核酸检测能力的通知》 、《新冠病毒核酸筛查稀释混样检测技术指引》 等内
容编制。
三、
适用范围
本预案适用于提升本县新型冠状病毒核酸检测能力。
四、
工作原则以人为本, 健全机制。
应切实履行公共服务职能, 把保障公众健康和生命安全作为首要任务, 最大程度减少突发疫情的发生引起造成的人员伤亡和危害, 把突发疫情应急工作 7 与公共卫生工作紧密结合起来。
通过建立完善应急机制, 为应对突发疫情提供保障。
五、
成立提高核酸检测能力应急领导小组
组 长:副组长:成 员:领导小组办公室设在卫健局医政股,XXX 同志任办公室主任, 负责日 常具体工作。
六、
核酸检测对象范围
根据疫情防控工作需要和检测能力, 领导小组确定并动态调整检测策略和人群范围。
( ( 一) ) 重点人群“ “ 应检尽检 ”8+1+1 类人员: :
1.密切接触者; 2.境外入境人员; 3.发热门诊患者; 4.新住院患者及陪护人员; 5.医疗机构工作人员; 6.口岸检疫和边防检查人员; 7.监所工作人员; 8.社会福利养老机构工作人员。
8 省上要求加做学校教师员工。
应对当前北京新疫情, 市里新增了对农贸市场工作人员、冰鲜销售人员、冷链仓储运输从业人员等。根据疫情防控需要, 必要时, 对重点地区来 XX 人员,无法提供达到目 的地前 7 天核酸检测阴性证明或血清病毒特异性 IgG 抗体检测阳性的, 免费提供核酸检测。
( ( 二) ) 其他人群“ “ 愿检尽检” ” 。
根据本地实际确定和动态调整优先检测人群。
( ( 三) ) 加强公众监测预警。
疾控中心定期对普通人群进行抽样监测和流行病学调查, 做好信息收集、分析研判和监测预警工作。
根据疫情发展变化动态调整常态化防控措施和动态推进应检尽检。
七、
检测机构分工
县疾控中心负责“应检尽检”(密切接触者, 境外入 XX 人员, 参与口岸检疫的排查人员、监所工作人员、纳入社区管理的重点地区来 XX 人员)、抽样监测和流调等对象提供免费核酸检测;县医院、中医院负责发热门诊患者、入(住)院患者及陪护人员、医疗机构工作人员的核酸检测工作;社会福利养老机构工作人员、重点地区返学返岗返工人员和其它“愿检尽检”人员提供自费核酸检测服务;根据工作需要,按照县卫健局的安排, 协助参与免费核酸检测对象的检测工作。
县新冠病毒 9 检测工作领导小组定期召开协调会议, 研究解决扩大核酸检测工作的重点难点问题, 并根据疫情防控形势及时动态调整。疫情发生时, 根据检测需要, 领导小组分配任务, 由县
医院、中医院、县疾控中心密切配合完成任务。
八、
严格规范开展检测
各检测机构要严格按照最新版的《新型冠状病毒肺炎实验室检测技术指南》 要求, 严格按照国家相关标准配备生物安全防护用品, 确保工作人员防护到位, 杜绝生物安全事故发生。
加强人员培训、强化质量控制, 落实实验室能力建设标准体系认证和实验室室内质控, 根据安排常态化接受上级临床检验质量控制和室间质评。
落实检测信息报告制度, 严格按上级要求做好信息录入, 准确做好患者检测标本信息登记工作, 详细填报新型冠状病毒检测标本送检表, 保证检测标本信息可追溯。
九、
提升检测能力
县医院、中医医院、疾控中心要加快落实设备采购, 主动对接上级业务部门加强业务培训, 增加人员培训, 确保应急需要时能够“三班倒”不间断工作。
要进一步完善质量管理体系建设, 确保按照要求在县域内能够规范安全开展核酸检测。10 突发疫情意外情况, 提高核酸检测能力的处理方法可参照《新冠病毒核酸筛查稀释混样检测技术指引》 执行。新冠病毒核酸筛查稀释混样检测技术指引 ( ( 一) ) 适用对象
新型冠状病毒核酸筛查稀释混样技术(以下简称稀释混样)仅适用于大人群样本的筛查,稀释混样检测结果不作为最终确诊依据。
在人群总体阳性率较低(低于 0.1%)时更为适宜。
以下人群不建议采用稀释混样检测:重点区域人群(近期有疫情发生的小区含确诊病例和无
症状感染者、老旧小区、人口密集小区、流动人口聚集区和近期离省外出人群)、其他不适合稀释混样检测的人群;医疗机构就诊患者。
( ( 二) ) 实验室条件
根据《病原微生物实验室生物安全管理条例》 (国务院 424 号令),具备在南平市卫生健康委备案的生物安全二级及以上实验室。根据《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》 (卫办医政发〔2010〕 194 号), 具备经过省级卫生健康行政部门审核备案的临床基因扩增检验实验室。
( ( 三) ) 生物安全要求
根据《国家卫生健康委办公厅关于医疗机构开展新型冠状病毒核酸检测有关要求的通知》 (国卫办医函〔2020〕 5311 号)和《新型冠状病毒实验室生物安全指南(第二版)》 的有关要求, 采样和实验室检测人员应采用生物安全三级实验室级别的个人防护。
检测工作完成后, 废弃物严格按照文件要求处理, 不得保存样本。
( ( 四) ) 操作流程
1.材料准备
①采样管。
常规采样管, 含病毒保存液 3ml 的标准采样管。
②咽拭子 ③振荡器。
④其他开展核酸检测的常规物质准备。
2.采样与混合
①咽拭子采样方法。
被采集人员头部微仰, 采样者将拭子越
过舌根, 在被采集者两侧咽扁桃体稍微用力来回擦拭至少 3 次, 将拭子头浸入含 1~3ml 病毒保存液的管中, 尾部弃去, 旋紧管盖。
②样本混合。
将采集的数个样本(原则上不超过 5 个)各取 200ul 进行充分混合, 形成混合待检样本。
3.核酸提取与检测过程
按新冠新冠病毒核酸检测标准操作流程进行。
每一次上样扩增中, 80 个加样孔用于加入混合样本(如 5 混 1, 总计 80×5 个单样本);10 个加样孔用于单样本(单样本来自上述 80×5 个原液的随机样本)。12 4.阳性结 果判断与重测检测结果先按照各检测试剂盒使用说明书的要求, 对被检测基因位点逐一判定, 出现任一位点阳性或能测出 Ct 值的混合样本, 均作为重测对象。混合样本检出 Ct 值, 其所有的单个原液样本需重新取样, 按照常规方法进行单样本核酸检测。单样本检出阳性, 其所在混合样本要全部按常规方法进行单样本核酸检测。
5.质量控制
①室内质控。
每批上样检测应当在剩余加样孔中设置 1 个阳性对照样本和三个阴性质控样本(2 份生理盐水和 1 份阴性混合样本)。
3 份阴性质控样本随机放在临床样本中间。
弱阳性质控测定为阳性, 3 个阴性质控全部测定为阴性, 视为在控。
反之, 则为失控, 不可发出报告, 应分析原因, 必要时重新检测样本。
②室间质评。
实验室每季度参加省级临床检验中心组织的新冠病毒核酸检测室间质量评价(EQA)活动, 按照活动要求完成质评物
接收、储存、检测和回报检测结果等工作。
6.注意事项 ①注意避免采样过程中的交叉污染, 落实一人一消毒;混样室在每进行一批样本稀释混样操作后, 应进行消毒处理。13②拭子应完全浸润在病毒保存液中, 样本在混合前后充分震荡(在振荡器上振荡 30 秒)。
③稀释混样检测必须提取核酸, 禁用“一步法”。
④建议对试剂检测灵敏度进行评估, 应选择灵敏度较高的检测试剂。
⑤稀释混样检测的阴性样本按每批次扩增留取一份阴性样本备查。
⑥实行 24 小时检测制, 最大限度提高检测能力, 切实做到“应检尽检” “愿检尽检” 。⑦做好核酸检测能力储备工作:在做好常态化疫情防控工作的同时, 要未雨绸缪, 为应对可能出现的聚集性疫情做好核酸检测能力储备, 包括硬件储备、软件储备和人员储备等。
为此, PCR 室已经申请购置新的扩增仪, 一旦出现疫情时, 要根据需检测的“四类人员”数量, 分梯度制订相应的应对措施, 迅速调集资源, 确保短时间内迅速提高检测能力。
十、
落实检测经费
争取县财政部门的支持, 加大核酸检测经费保障力度,根据本文件规定和领导小组确定的免费检测对象, 据实拨付核酸检测工作经费;非免费对象的检测经费由主体单位或业主组织负责;自愿检测人
员检测费用自理。
公立医院新冠病毒检测费用标准按照医保部门规定执行。
篇三:
为全面做好我县新冠肺炎疫情防控工作, 有效应对秋冬季可能发生的新冠肺炎疫情, 落实好“四早” 要求, 充分发挥实验室核酸检测在疫情应对与处置中的技术支撑作用, 结合我县实际, 特制定本预案。
一、
编制目的
根据省、市关于做好秋冬季新冠肺炎疫情防控工作的要求, 积极应对可能新出现的新冠肺炎疫情, 在出现确诊病例和划定为“中高风险”地区后, 按照及时、有效、科学、精准的原则, 对疫情可能波及的人群开展核酸检测, 实现 5-7 天内完成县域内全员核酸检测工作。
二、
编制依据
依据《国务院应对新型冠状病毒肺炎疫情联防联控机制综合组关于进一步加快提高医疗机构新冠病毒核酸检测能力的通知》 (联防联控机制综发〔2020〕 204 号)
、国家卫生健康委《应对秋冬季新冠肺炎疫情应急预案》 、《新型冠状病毒肺炎防控方案(第七版) 》 、《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第八版) 》 、《XX 省新型冠状病毒肺炎疫情防控应急预案(第三版) 》、《医疗机构新型冠
状病毒核酸检测工作手册(试行)》、《新冠病毒核酸复查稀释混样检测技术指引》 等。
三、
组织体系及职责
(一)
成立新冠肺炎疫情应急核酸检测工作领导小组
组 长:
XXX 副组长:
XXX、XXX XXX、XXX 成员:
(略)3 (二)
职责分工
1.县卫健委:
牵头制定全员核酸检测工作预案; 督促指导辖区医疗卫生机构加强新冠病毒核酸检测能力建设, 做好核酸检测能力储备; 本县发生新冠肺炎病例时, 迅速调集核酸检测医疗资源, 合理确定核酸检测机构及采样点, 确保短时间内迅速提高核酸能力; 必要时协调上级机构或第三方检测机构参与核酸检测工作。
2.县公安局:
负责核酸采样点现场秩序维护和安全保卫工作。
3.各镇人民政府:
根据属地化管理原则, 开展新冠肺炎疫情防控工作, 负责辖区内被检测人员的组织, 核酸检测场地选择、准备、现场维护和消毒消杀等有关保障工作。
4.县人民医院、疾控中心:
结合实际, 做好核酸检测所需的各类设备、防护用品、检测试剂的储备工作; 加强核酸检测技术培训, 建立核酸采样、检测人员后备梯队, 提高检测技术水平, 保障全员核酸检测需求; 疫情发生时, 在县新冠肺炎疫情应急核酸检测工作领导小组的统一领导下, 做好新冠肺炎核酸检测的采样、
送检、实验室检测等工作。
四、
核酸采样和检测队伍准备
(一)
成立新冠肺炎疫情核酸检测采样组
组 长:
XXX 副组长:
XXX 成 员:
(略) 联络人:
XXX XXXXXXXXXX 工作职责:
日常情况下负责本单位核酸采样工作;
应急情况下接受 4 县疫情防控指挥部统一调度, 负责全县核酸采样工作。
(二)
成立新冠肺炎疫情核酸检测组
组 长:
XXX 副组长:
XXX 成 员:
(略) 联络人:
XXX XXXXXXXXXX 工作职责:
疫情防控期间, 接受县防控指挥部统一调度, 负责全县核酸检测实验室核酸检测工作 五、
核酸检测物资和试剂准备。
我县下辖 X 个镇, XX 个村(社区)
, 常住人口 XXXXXX 人, 按照疫情发生时, 5-7 天内完成县域内全员核酸检测的目标要求测算, 采用稀释混样检测技术 1: 10, 日核酸检测份额不少于 XXXXX 份。县人民医院、疾控中心要做好核酸检测所需的各类设备、
防护用品、检测试剂等储备工作。
检测试剂按全员核酸检测测算需求, 备齐核酸提取试剂(96 人份/盒)
150 余盒, 新冠病毒 PCR 检测试剂盒(50 人份/盒)
300 盒, 各类耗材、防护用品均需满足检测需求。
六、
核酸检测能力建设
(一)
加强县级核酸检测能力建设
按照《新型冠状病毒肺炎实验室检测技术指南》 《新冠病毒核酸检测技术人员培训方案》 等要求, 加强标本采集、保存、运输、接收整理、核酸提取、试剂使用、荧光定量等检测方法、结果报告、生物安全等全流程培训, 确保核酸采样、检测工作人员满足全员核酸检测能力需求。5 县人民医院和疾控中心 PCR 实验室核酸检测工作人员获得检测合格证书的人数要各达到 6 人以上。
合理调配人力资源, 保证检测仪器正常运转、检测人员“三班倒” , 满负荷检测情况下, 县人民医院、疾控中心日核酸检测份额合计达 736 份标本以上, 采用稀释混样检测技术 1: 10, 日核酸检测份额合计达 7360 份标本以上。
(二)
依托第三方提升 核酸检测能力
依托第三方核酸检测机构提升我县核酸检测能力, 积极协调合肥迪安等检测机构加入我县核酸检测体系, 签订全员核酸检测协议, 增加日核酸检测份额 30000 份, 使得我县日核酸检测份额达 37360 份, 以满足全员核酸检测需求量。
七、
统筹调度计划安排
当发生疫情需进行全员核酸检测时, 各镇在全力落实各项防控措施基础上, 根据以下要求做好全员核酸检测实施工作。
(一)
呼吸道标本的采集。各镇、村(社区)
负责辖区内被检测人员的组织工作, 需制定工作方案, 主要负责被检测人员的通知、登记、宣传和现场保障等工作。
按照每个临时采样点 3-5 名人员的原则配备工作人员, 包括负责人、登记人员和联络员等, 抽调成立的核酸检测采样工作组人员全体上岗工作,由县疫情防控指挥部统筹调度, 按照每 4000-5000 名居民配备 4-5 名采样人员的原则开展标本采集工作。
)
(二)
。
临时采样点的设置。以划定的最小单位(如楼栋、病区、居民小区、自然村组等) 为单位 6 设置临时采样点, 由所在的镇、村(社区)
负责选择室外空旷阴凉通风场地, 搭建临时帐篷, 配备充足的桌椅, 悬挂醒目标识, 现场分登记区和采样区, 配备足量的采样设备, 个人防护用品和健康宣教材料, 每半天对现场相关物品消杀一次, 如为室内临时采样点, 应使用分体式空调,配备充足的桌椅, 室外悬挂醒目标识, 入口处设置登记区, 采样区内备有足量的采样设备、个人防护用品和健康宣教材料, 室内环境和物品 4 小时消杀一次, 同时每个临时采样点配备 1-2 名警务人员, 负责维持现场秩序和安全保障工作, 确保“中高风险” 区域核酸检测全员覆盖。
(三)
核酸样本的检测。由县疫情防控指挥部统筹安排, 第一时间激活县人民医院、疾控中心和第三方检测机构的检测能力,
按照国务院联防联控机制印发的《新冠病毒核酸筛查稀释混样检测技术指引》 要求, 采用混样检测方法开展检测。
检测结果应当在 12 小时内反馈。